ก่อตั้งเมื่อวันที่ 1 กรกฎาคม 2482  เป็นโรงเรียนสาขาศึกษา ประจำตำบลโพนทัน 2  ใช้ศาลาวัดบ้านแหล่งหนูเป็นสถานที่เรียน    โดยตั้งชื่อว่า “โรงเรียนประชาบาลตำบลโพนทัน 2 สาขาวัดบ้านแหล่งหนู” โดยมีนายพวง ทองสมบัติ ทำหน้าที่เป็นครูหัวหน้าสาขา เมื่อวันที่ 1 มิถุนายน 2483    จึงได้ย้ายมาตั้ง ณ สถานที่ปัจจุบัน โดยอาศัยแรงชาวบ้านและ งบประมาณจากทางราชการ 6,000 บาท สร้างเป็นอาคารเรียนถาวร 1 ชั้น 4 ห้องเรียน และ ตั้งชื่อโรงเรียนเป็นอิสระชื่อว่า  “โรงเรียนบ้านแหล่งหนู” โดยมีนายทุย  แก้วศิริ เป็นครูใหญ่คนแรก เปิดสอนตั้งแต่ชั้นประถมศึกษาปีที่ 1 ถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 4   

                 ปัจจุบันโรงเรียนได้เปิดสอนระดับปฐมวัย ชั้นอนุบาล 1 ถึงระดับประถมศึกษาชั้นประถมศึกษาปีที่ 6 โดยรับนักเรียนจากหมู่บ้านแหล่งหนู หมู่ที่ 6 และหมู่ที่ 7 ตำบลดงเจริญ อำเภอคำเขื่อนแก้ว จังหวัดยโสธรเข้าเรียน