โรงเรียนบ้านน้ำคำน้อย ตั้งอยู่หมู่ที่  2 ตำบลน้ำคำใหญ่ อำเภอเมืองยโสธร  จังหวัดยโสธร สังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษายโสธร  เขต  1  ก่อตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 24 มิถุนายน พ.ศ. 2524 ในที่ดินสาธารณประโยชน์ มีเนื้อที่  12 ไร่  250 ตารางวา  จากความเห็นชอบของสภาตำบลน้ำคำใหญ่ ซึ่งแยกจากโรงเรียนบ้านตับเต่า  โดยการนำของผู้ใหญ่บ้าน คือ นายอี แก่นสุวรรณ  พระครูสุวรรณ (พระครูธรรมโชติรัตน์)  เจ้าอาวาสวัดบ้านน้ำคำน้อย และชาวบ้านได้ร่วมกันสร้างอาคาร 1 หลัง ได้รับงบประมาณสนับสนุนจากองค์กรต่าง ๆ เป็นค่าก่อสร้าง 55,000 บาท มีผู้บริหารครั้งแรกในปี พ.ศ.2525 คือนายอุทัย  โคตรสมบัติ  ปัจจุบัน คือ นางจุรีรัตน์  พินิจมนตรี